3. 利用Illumina公司研发的猪高密度SNP芯片(6万个SNPs),对该近交家系中的F17至F226个世代共96个样品的基因型进行了系统测定,并与非近交系五指山猪进行比对分析。发现分布于近交系 18对常染色体上的50,418个有效SNPs中,F20 SNPs已被固定的比例高达80.0%以上, 而非近交系五指山猪的所有染色体区域均表现高度杂合,50,418个有效SNPs弥漫性、均匀性、无规律的分布18个染色体。6个世代96个样本X染色体基因组的1095个SNPs位点中,虽有182个位点具有一定的多态性,但基因组纯合区高达83.4%,而16个海南五指山猪样本几乎无一纯合,这一结果说明两者遗传基础已经完全不同。48 头WZSP近交系(F20-F22)个体7号染色体上与MHC 免疫相关的13个基因中,F22个体全部纯合,F20和F21仅有一个基因杂合,而对照组无一纯合,该结果不但为其异体皮肤移植不发生免疫排斥反应提供了依据,而且在分子遗传学的层面上,再次证明一种新的遗传资源诞生。